历来的植物分类学和树木分类学教科书，均将银杏这一植物划入裸子植物的范畴。这种划分方法，主要是根据银杏的花果结构而加以确定的。

  但是银杏和一般裸子植物又有所不同。其最大的不同之处在于它有宽大的叶片和带有浆汁外种皮的种子。因此在林业界把裸子植物中具有针叶或鳞叶的松柏类植物列入针叶树种，而却把银杏列入阔叶树种。所以银杏虽与松柏类周属裸子植物，但在一般入看来，银杏与被子植物中的杨、柳极相类似，因而常常把银杏的雄花称为葇荑花序，把银杏的种子称作果实（浆果或核果）。严格说来，这些称谓都是不恰当的。但是习惯了的称呼一时很难改变，因此至今许多人依然把带有浆汁外种皮的银杏种子称作银杏果，把银杏的种核称作银杏种子。对于这个问题虽然没有必要过多的讨论，但是对银杏的花果特征和银杏在植物学中的分类地位有一个比较清楚的了解，还是完全必要的。