银杏是裸子植物，没有一般花的构造，只有裸露的雌、雄性器官。银杏雌性器官小。银杏是雌雄异株植物，雌、雄性器官着生在不同的植株上。由于嫁接或者在老树的 腐朽部位天然更新、逐步自然愈合等情况的存在，使自然界出现了相当数量的雌雄同株银杏。但是，来自雌树的枝条仍然保持雌性，来自雄树的枝条仍然保持雄性。

      银杏的雌性器官结构简单，由珠柄、珠盘和胚珠三部分组成，着生在银杏短枝的叶腋内。银杏的雄性器官本身就是由叶原基发育而成的，也就是说，它的着生部位就是叶子的着生点。珠柄基部圆形，长1.0~5.0厘米，柄端一般分成两叉，末端膨大成盘状，形成珠盘。每个珠盘内着生一粒裸露胚珠。胚珠的珠孔朝上。

      银杏的珠柄与银杏的叶柄基本上为同步生长。在一个短枝上可以着生2~10根珠柄，待珠柄伸长到一定长度时，胚珠开始加速发育。一般于3月上中旬胚珠的珠孔出现“传粉滴”。“传粉滴”以早晨最为明显，傍晚基本消失。在一个胚珠上可以连续3~7天见到传粉滴。胚珠授粉后，传粉滴迅速干枯，珠孔也全部封闭。在见到传粉滴的期间，特别是在见到传粉滴的第2~5天授粉，可以大幅度提高银杏产量。

      银杏雄性器官的结构较为复杂，呈柔荑花序状，很像没成熟的桑椹。花序长2.0厘米左右，柄长1.0厘米左右。每个短枝上雄花序2~5个，最多8个。花序上着生20~60个或更多一些花药。花药柄长1~2毫米，每柄上反向着生一对花药，也可见到3个以上的花药着生在一个柄上。这种反向着生方式及偶尔的多花药现象，都表现了银杏起源的原始性。

      银杏是风媒植物，雄株产粉量大，花粉粒也较小。每个花药内含花粉4000~6000粒。花序上的花药自下而上成熟开裂。一枚花药大约在3天内散粉完毕。一株雄树的散粉期为7~10天。银杏雄树散粉的时间，一般能与当地雌树胚珠“传粉滴”的形成相吻合，但也存在过早或过迟散粉的银杏雄树植株。同一地区不同雄树的散粉期，可以相差20~30天。所以，选择同步散粉或散粉期长、花粉活力强的雄株作为授粉树，是银杏生产中必须注意的。

      银杏的花粉易于贮藏。干燥花粉，常温可维持有效授粉能力15天以上。摊凉干燥的银杏花粉，在0℃左右的条件下，可以较长时间保持有效授粉能力。在干燥条件下冷藏银杏花粉，其活力甚至可以保持7~8年。